近年來生物醫學知識的快速發展使分子細胞生物學，基因體學和蛋白質體學的研究全面提昇，以驚人的速度做全方位的突破。如何把這些新的科學知識應用到臨床醫療來提升對病患的醫療水準和人類健康，卻也形成待突破的瓶頸。成大臨醫所師生努力的目標就是將這個鴻溝弭平，把包括感染免疫學，癌症生物學，神經生物學，幹細胞生物學與新陳代謝學各領域的研究與臨床應用合而為一，共同面對二十一世紀世界人類的醫療學術挑戰。
經由轉譯醫學課程與實驗室研究的訓練，成大臨醫所提供對醫療人員與生物醫學科學家的碩士級與博士級的學位課程。經由與成功大學各系所的合作以及與成大醫院臨床醫學研究部的同步發展，本所已經成為培育醫學各領域研究人才的溫床。希望大家一起來瞭解臨醫所，並且經由參與我們的努力，讓大家的臨床醫學研究更加豐富茁壯。
以人類疾病研究為導向，
培養優秀臨床醫學與轉譯醫學研究人才。
- 培養兼知臨床與基礎研究方法的醫師科學家（physician scientist），使其具有獨立創新的研究能力，發現且解決醫學重要問題，以造就其成為臨床醫學的研究人才。
- 培育轉譯醫學的研究人才。
1997年
王乃三院長委任陳志鴻教授籌劃『臨床醫學研究所博士班』，於1998年8月招收博士班在職生。
1998年8月
首任所長蘇益仁教授 (1998.8~2000.8)，兼任臨醫部主任，設立核心實驗室。
2000年8月
張定宗教授 (2000.8~2002.8) 接任所長，將修業學程制度化。
2002年8月
林炳文教授 (2002.8~2005.4)接任所長，成立『臨床醫學研究所碩士班』，於2005年8月招收碩士班。
2005年4月
遴選黃朝慶教授為所長，成立『臨床醫學研究所碩士在職專班』，於2007年8月招收碩士在職專班生。
2006年9月
陳志鴻院長決策住院大樓12C及9B由臨床醫學研究所及中心規劃整合使用。
2006年9月
陳志鴻院長決策住院大樓12C及9B由臨床醫學研究所及中心規劃整合使用。
2008年8月
招收『臨床醫學研究所碩士班一般生』，健全研究人員多樣性及完整性。
2009年8月
招收『臨床醫學研究所博士班一般生』，轉譯醫學人才訓練更臻完善。
2010年6月
搬遷至門診大樓七樓，至此具備完整空間。
2011年8月
遴選謝奇璋教授(2011.8~2017.8)為所長。
2012年8月
接辦再生醫學卓越中心設立之『再生醫學科技學分學程Regenerative Medicine Technology Program』。
2013年8月
獲教育部通過與中央研究院合辦『跨領域神經科學國際博士學位學程 TIGP on Interdisciplinary Neuroscience』。
2014年8月
『跨領域神經科學國際博士學位學程 TIGP on Interdisciplinary Neuroscience』開始招收博士班學生。
2017年8月
遴選沈延盛教授(2017.8~2019.7)為所長。
2019年8月
沈延盛教授榮任醫學院院長，派請劉秉彥教授(2019.8~2020.7)代理所長。
2020年8月
與電資學院及智慧運算學院跨域合作設立『智慧生醫學分學程Program on Artificial Intelligence of Technology and Biomedicine』。
2021年8月
『臨床醫學研究所碩士在職專班』，於2007年8月招收『臨床試驗組』。
2023年8月
劉秉彥教授接任成大醫院與醫學院內科部主任，派請蘇文彬教授代理所長。
2023年7月
洪澤民教授2008年任教本所迄今15年，於7月榮退！
2024年8月
遴選蘇文彬教授(2024.8~迄今)為所長。
2023.8 ～ | 蘇文彬教授／腫瘤醫學科 |
2019.8 ～ 2023.7 | 劉秉彥教授／內科 |
2017.8 ～ 2019.7 | 沈延盛教授／外科 |
2011.8 ～ 2017.7 | 謝奇璋教授／小兒科 |
2005.4 ～ 2011.7 | 黃朝慶教授／小兒科 |
2002.8 ～ 2005.3 | 林炳文教授／外科 |
2000.8 ～ 2002.8 | 張定宗教授／內科 |
1998.8 ～ 2000.7 | 蘇益仁教授／病理科 |